Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam107bQ3TGF2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam107bQ3TGF2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam107bQ3TGF2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms