Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hp1bp3Q3TEA8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hp1bp3Q3TEA8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms