Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB82

Plekhf1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhf1Q3TB82 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plekhf1Q3TB82 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plekhf1Q3TB82 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plekhf1Q3TB82 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plekhf1Q3TB82 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plekhf1Q3TB82 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plekhf1Q3TB82 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plekhf1Q3TB82 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plekhf1Q3TB82 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plekhf1Q3TB82 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms