Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr27Q3SYJ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms