Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccbe1Q3MI99 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms