Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms