Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col24a1Q30D77 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms