Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna5Q2MKA5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna5Q2MKA5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms