Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam178bQ24JP3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam178bQ24JP3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms