Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
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Shroom4Q1W617 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Shroom4Q1W617 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
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Shroom4Q1W617 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Shroom4Q1W617 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
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