Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms