Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim71Q1PSW8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms