Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
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Tdrd9Q14BI7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
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Tdrd9Q14BI7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
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Tdrd9Q14BI7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
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Tdrd9Q14BI7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tdrd9Q14BI7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
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Tdrd9Q14BI7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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Tdrd9Q14BI7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
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Tdrd9Q14BI7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms