Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Perm1Q149B8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Perm1Q149B8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Perm1Q149B8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Perm1Q149B8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Perm1Q149B8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Perm1Q149B8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms