Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli2Q0VGT2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli2Q0VGT2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms