Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd12Q0VE29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms