Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hif3aQ0VBL6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms