Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5cQ0V8T7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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