Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms