Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms