Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Neurl1bQ0MW30 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1bQ0MW30 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms