Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TrioQ0KL02 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms