Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms