Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms