Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tff1Q08423 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms