Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms