Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn1Q08091 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms