Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms