Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1bQ06985 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms