Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp2Q06649 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms