Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPINDOCQ05AH6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPINDOCQ05AH6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms