Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal1Q05A62 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms