Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprgQ05909 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms