Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rcn1Q05186 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rcn1Q05186 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms