Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdk18Q04899 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk18Q04899 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms