Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox13Q04891 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms