Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox10Q04888 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms