Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms