Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx1Q04742 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms