Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdk16Q04735 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms