Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarcad1Q04692 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms