Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpd1Q04519 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd1Q04519 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smpd1Q04519 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms