Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelaQ04207 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RelaQ04207 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms