Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms