Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms