Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms