Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb5Q02739 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms