Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms