Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms