Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col1a2Q01149 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms